حتى عام 1925 كانت تقع في منزل Leontovich في شارع أدميرالسكايا (في موقع اللجنة التنفيذية الإقليمية الحالية) ، وتم توسيعها منذ عام 1925 ، وهي تقع في مكان جديد - بالقرب من محطة الحافلات المركزية في موقع مقبرة المدينة القديمة. انها تحتل حاليا مساحة 18.48 هكتار.
في عام 1993 ، تم قبول الأول من بين حدائق الحيوان في أوكرانيا في الاتحاد الأوروبي لحدائق الحيوان وحدائق الأحياء المائية (EAZA). يشارك في 18 برنامجًا لتربية الحيوانات النادرة في أوروبا (EERs) ، وهو عضو في الرابطة الإقليمية الأوروبية الآسيوية لحدائق الحيوان وحدائق الأحياء المائية (EARAZ) ، النظام الدولي للمحاسبة على الحيوانات (ISIS). في مايو 2003 ، كانت حديقة حيوانات ميكولايف أول حديقة للحيوانات في أوكرانيا يتم قبولها في الرابطة العالمية للحيوانات وحدائق الأحياء المائية (WAZA).
مدير حديقة الحيوان ، فلاديمير توبشي - عضو مجلس إدارة EAZA